Pandas добавляет дополнительную строку в DataFrame при присвоении индекса

Пустая строка в распечатке, которую вы видите, состоит в том, что index имеет имя – Gene.name ( Gene.name это не настоящая строка в DataFrame). Если вы не хотите эту строку, я считаю, что вам нужно будет покончить с этим именем. Пример –

 df.index.name = None 

Демо –

 In [6]: df = pd.DataFrame([[1,2,3,4],[1,2,3,4]]).set_index(0) In [7]: df Out[7]: 1 2 3 0 <-------------------------- Name of the index for this DataFrame 1 2 3 4 1 2 3 4 In [10]: df.index.name=None In [11]: df Out[11]: 1 2 3 1 2 3 4 1 2 3 4