Tag: подпроцесс подпрограммы

Несколько труб в подпроцессе

Я пытаюсь использовать Sailfish, который принимает несколько файлов fastq в качестве аргументов в конвейере ruffus. Я выполняю Sailfish, используя модуль subprocess в python, но <() в вызове подпроцесса не работает, даже когда я устанавливаю shell=True . Это команда, которую я хочу выполнить с помощью python: sailfish quant [options] -1 <(cat sample1a.fastq sample1b.fastq) -2 <(cat sample2a.fastq […]

Python - лучший язык программирования в мире.