Tag: scipy

Большая цветовая палитра в matplotlib для дендрограммы SciPy (Python)

Я пытаюсь расширить свою color_palette в matplotlib или seaborn для использования в дендрограмме scipy , чтобы она окрашивала каждый кластер по-разному. В настоящее время color_palette имеет только несколько цветов, поэтому несколько кластеров получают сопоставление с одним цветом. Я знаю, что есть 16 миллионов цветов RGB , поэтому … Как я могу использовать больше цветов из […]

Возобновление оптимизации в scipy.optimize?

scipy.optimize представляет множество различных методов локальной и глобальной оптимизации многомерных систем. Тем не менее, у меня очень длительный процесс оптимизации, который может быть прерван (и в некоторых случаях я могу намеренно прервать его). Есть ли способ перезапустить … ну, кто-нибудь из них? Я имею в виду, что можно дать последний, самый оптимизированный набор параметров, найденный […]

Как создать скудную разреженную матрицу из фреймворка pandas?

Я ищу лучший способ создать скудную разреженную матрицу из фреймворка pandas . Вот псевдокод, для которого у меня сейчас есть row = []; column = []; values = [] for each row of the dataframe for each column of the row add the row_id to row add the column_id to column add the value to […]

scipy.spatial.ckdtree работает медленно

Я использовал spatial.cKDTree в scipy для вычисления расстояний между точками. Он всегда работал очень быстро (~ 1 с) для моих типичных наборов данных (поиск расстояний для ~ 1000 точек до массива ~ 1e6 точек). Я запускаю этот код в python 2.7.6 на компьютере с Ubuntu 14.10. До сегодняшнего утра я управлял большинством пакетов python с […]

Ошибка (?) При выборе узлов в функции splrep scipy.insterpolate

У меня есть этот вопрос о функции splrep от scipy, который, я думаю, является ошибкой, поэтому я размещаю каждый фрагмент кода, чтобы вы могли воспроизвести его на своих компьютерах. Предположим, что я хочу найти b-сплайн-представление некоторых данных, например, полученного по следующему коду, который создает набор данных в виде смеси десяти гауссиан с некоторым добавленным шумом: […]

Оценки и условия Scipy curve_fit

Я пытаюсь использовать curve_fit для подгонки некоторых данных. он отлично работает, я хотел бы улучшить соответствие с дополнительными параметрами для соответствия предположениям (например, механическая эффективность не может превышать 100% и т. д.), y_data = [0.90 0.90 0.90 0.90 0.90 0.90 0.90 1.30 1.30 1.30 1.30 1.20 1.65 1.65 1.65 1.65 1.65 1.65 1.80 1.80 1.80 […]

Прочитайте файл Nist Wav в базе данных TIMIT в массив python numpy

Это возможно?? Кажется, я получаю эту ошибку при использовании wavread из scikits.audiolab: x86_64.egg/scikits/audiolab/pysndfile/matapi.pyc in basic_reader(filename, last, first) 93 if not hdl.format.file_format == filetype: 94 raise ValueError, "%s is not a %s file (is %s)" \ —> 95 % (filename, filetype, hdl.format.file_format) 96 97 fs = hdl.samplerate ValueError: si762.wav is not a wav file (is nist) […]

tile для создания csr_matrix из одной строки другой csr_matrix

У меня есть csr_matrix 'a' тип разреженной матрицы. Я хочу выполнить операцию для создания новой csr_matrix 'b', где каждая строка 'b' совпадает с той же строкой 'a'. Я думаю, что для обычных массивов numpy можно использовать операцию «tile». Но я не могу найти то же самое для csr_matrix. Создание первой матричной матрицы и преобразование в […]

Scipy редкий решатель dia_matrix

В scipy-программе я создаю dia_matrix (разреженный тип матрицы) с 5 диагоналями. Центральная диагональ диагоналей +1 и -1 и диагоналей +4 и -4 (обычно >> 4, но принцип тот же), т. Е. Я имею типичную матрицу системы PDE вида: [ a0 b0 0 0 0 d0 0 0 0 … 0.0 ] [ c1 a1 b1 […]

python anano Ошибка оптимизации из-за: local_dot_to_dot22

Я просто установил приложение anano и попытался запустить theano.test (). Он произвел очень длинный журнал ошибок, и я скопировал первую часть. Я также попробовал пару других примеров – я видел "local_dot_to_dot22" а также "ValueError: invalid token "Files\Enthought\Canopy\App\appdata\canopy1.5.2.2785.win-x86_64\Scripts" in ldflags_str: "-LC:\Program Files\Enthought\Canopy\App\appdata\canopy-1.5.2.2785.win-x86_64\Scripts -lmk2_core -lmk2_intel_thread -lmk2_rt" несколько раз. Я использую python 2.7 (навес), scipy 0.15.1-2 и numpy […]

Python - лучший язык программирования в мире.